厂化育苗的催芽、绿化、炼苗时期的温度、光照的管理，与常规育苗的管理基本相似，这方面的研究已很多，可参照用于工厂化育苗的生产管理。由于工厂化育苗采用的基质、容器等不同于传统育苗，在很多方面亦有不同的技术要求。

　　(1)基质水分管理 工厂化育苗采用的基质在持水、保水能力等方面普遍差于土壤，易失水干燥，所以在水分管理上要求较高，在基质搅拌时就应加入适量水，播种覆盖后尤其要将水浇足，一般要求基质含水量达到zui大持水量的85%-90%，以满足种子发芽时的水分需求，避免所播干种子吸水不足，甚至基质从种子倒吸水而影响出苗，降低发芽率，在催芽过程中也要注意适当补充水分，防止种子落干和戴帽出土。现代工厂化育苗工厂中催芽在电脑控制的可调温湿度的催芽室中进行，保证了种子能够顺利完成此过程，并使发芽均匀，出苗一致。在种子出土后，应适当降低基质含水量，一般在子叶展开～两叶一心时，含水量为zui大持水量的60～75%，三叶一心～出苗销售为45～60%，能够满足大多数作物的水分需求。阳光强烈，基质失水迅速时，一天可喷施营养液或清水2-3次，但要避免施用过晚，茎叶带水易感染病菌，提高了空气湿度而导致病害发生。在出苗前一天，应适当提高基质水分含量，以利定植时从盘中取苗，减少散坨。

　　(2)营养液管理 尽管在育苗基质中，特别是泥炭中，含有一定量的*N、P、K养分和微量元素，但作物苗期所需的养分，尤其是大量元素的供给主要靠营养液来提供。营养液管理的好坏，直接影响到幼苗生长的速度和幼苗质量。有研究表明，施用营养液的时间越早，对快速育苗越有利。在基质搅拌和播种覆盖后浇水时以低浓度营养液代替清水，有利于加快幼苗的前期生长，缩短育苗时间。 幼苗出土后，应及时浇施营养液，前期浓度不宜过高，浓度过高会降低幼苗生长速度，严重时会引起烧苗。随幼苗生长，苗龄增加，要逐步提高营养液浓度。

　　(3)营养面积选择 不同营养面积对幼苗前期的生长发育速度无显著影响，但营养面积过小会限制苗的后期生长发育，降低干物质的累积和光合速率，提高第二花序以上的花芽分化和座果节位，降低前期产量，但就总产量来说，苗期营养面积无显著影响，所以应根据作物种类、所育苗的用途来选择不同规格的育苗盘。茄果类我国习惯育大苗，用50孔育苗盘为宜，瓜类、甘蓝等多选用72孔育苗盘，芹菜等可以选用营养面积更小的育苗盘。