首先将发酵后的污水经固液分离机将猪粪与猪尿分离，猪粪另行处理。污水自流进入集水池，对污水进行预处理，目的是初步降低有机颗粒物质的含量，提高污水的同一性，集水池的污水经过污水提升泵进入到调节池，调节水质的同时加一号药剂，化学降解氨氮、总磷，然后经污水提升泵进入气浮机加二号药剂，三号药去除污水中细小悬浮有机物后进入A/O污水处理系统，进行厌氧、好氧生物反应单元作进一步生化处理。该单元兼有活性污泥法和生物膜法的处理工艺，有机废水从反应器的底部进入器内，向上流，氧化池内设置组合式立体弹性填料，填料上长着微生物，使表面形成一层生物膜，污水中的有机物在与生物膜的接触时被吸附分解，从而达到去除目的（生物膜法）同时连续的曝气。然后再经过消毒池进行去味消毒，确保污水经处理后各项指标全面达标。沉淀的污泥搜集到污泥池中，定期外运积肥处理。